超声波清洗机的清洗效果主要依靠“空化效应”。因此，“空化”效应的好坏可以影响机器的性能；而机器的性能决定了清洗效果。要想达到清洁的目的，就要追根溯源。因此，必须重视空化效应的影响因素。
(1)频率选择
即使在清洗液中引入超声波，也不一定会产生空化气泡；即使产生空化气泡，也可能不会完全爆破；即使爆炸，也不一定能达到很好的剥离污垢的效果。
每种液体都有自己的“空化阈值”。只有当超声波振动产生的负压超过液体本身的静压时，才能将其撕开，形成真空气泡。超声空化阈值与超声频率密切相关。
频率越高，空化阈值越高。因为超声波的频率越高，它的能量就会很低，也就没有那么大的力量来撕裂液体形成空化。因此，高频超声波不易在液体中形成空化气泡。为了产生空化，需要增加声功率。
反过来，频率越低，越容易产生空化。而且，当频率较低时，撕裂和挤压之间的时间间隔会更长。生成的囊泡有足够的时间完成生长，由小变大，因此爆炸时产生的冲击力更大。越大，越容易清洁。
高频和低频就像一匹马，跑得很快，但力量不大，拉不动太多的重量；牛跑得很慢，但力气很大，可以拉着一大车牛粪悠闲地散步。事实上，每种都有自己的用途。
我们可以根据清洗对象将超声波频率分为三个频段：低频（20KHz-50KHz）、高频（50KHz-）、超高频（-1MHz以上）。在相同功率下，40KHz频率超声波比超声波产生更多的空化气泡，穿透力更强，但很容易对仪器表面造成腐蚀和损坏，并发出更大的噪音。
因此，高频超声波适合清洗精密、精致的器械，低频超声波适合清洗大型、坚固的器械。
(2)清洗液性质的影响
常常需要在超声波清洗槽的水中添加清洗剂。清洗剂的选择一方面要根据污垢的类型选择有针对性的清洗剂。另一方面，还要考虑清洗剂对水造成的表面张力和粘度。性质的变化，因为这些性质与空化强度有关。液体的表面张力越大，越难产生空化。就像撕开一张胶片或一张牛皮一样，张力越大，需要的力就越大。同时液体粘度高，不易产生空化现象。因此，应选择低粘度的清洗剂。
(3)温度的影响
温度的升高有利于空化的产生。但如果温度过高，则会减少空化气泡的形成。并且每种液体都有自己的活性温度。水最活跃的温度约为60度。如果考虑多酶清洗剂的耐温能力，可以选择40度左右。
(4)气体的影响
超声波在传播过程中，如果遇到水中的气泡（不是空化气泡），就会影响其传播，导致空化气泡的产生受到影响。另外，如果产生的空化气泡扩散到气泡中，则会降低喷砂时的冲击力，影响清理效果。因此，使用超声波清洗机前应消除水中的气泡。
（五）其他影响
被清洗的物品也对超声波清洗效果有影响。由于其吸音作用，塑料类、布类器械及物品的清洁效果很差；而对于超声波反射能力较强的器械，如不锈钢、玻璃等，清洗效果会很好。另外，装载篮的网孔过密、放置器械过多、污染过多等也可能造成超声波能量的衰减，削弱清洗效果。