发酵一直被认为是塑造雪茄烟叶品质特征的关键生产步骤。
纵观世界主要雪茄烟叶产区的发酵，通常有两种不同的模式。
一是雪茄制造商拥有自己的农场，烟叶发酵的整个过程都由烟厂处理。
另一种是雪茄制造商从烟叶经销商那里采购雪茄烟叶。烟叶烘烤后，首先转运至烟叶经销商仓库进行集中初选、初发酵、分级。然后，雪茄制造商买回烟叶，在烟厂再次发酵。
目前国内的情况类似于上面提到的第二种模式，即雪茄工厂自己不种植雪茄烟叶，而是从烟草公司采购。因此，业界将雪茄烟叶发酵分为农业发酵和工业发酵两个不同的环节。
那么，农业发酵和工业发酵有什么区别，两个环节的分界点是什么？
想必，上述问题一定让包括笔者在内的很多业内人士感到困惑。经过再三思考，我大胆提出了一些建议，表达了个人的看法。
笔者认为农业发酵与工业发酵有以下主要区别：
首先，实施主体不同。农业发酵以企业为主体，在烟草公司开展；工业发酵以工业为主体，在雪茄工厂进行。
二是实施顺序不同。农业发酵属于前一环节，工业发酵属于后一环节。农业发酵是工业发酵的基础。
三是实施目的不同。农业发酵旨在提高烟叶均质化水平，解决常见问题。例如，可以促进蛋白质等大分子物质的降解和转化，减少绿气和刺激性，显露特征香气，提高均质化程度和工业可用性。
农业发酵的核心是均质化。
工业发酵旨在提高烟叶特性水平，解决个体问题。例如，根据特定雪茄产品的配方要求，采用相应的发酵工艺对烟叶进行特殊加工，使雪茄烟叶能够在均质化的基础上进行表征。
工业发酵的核心是专业化。
四是实施情况不同。农业发酵是大规模生产、规模大、周期长。主要是自然发酵（低温慢发酵）。精细化程度相对有限，往往需要数量和质量的平衡。
工业发酵是小批量生产，规模相对较小，环境可控程度较高，操作更加精细化。主要是人工发酵（高温高湿），周期比较短。
打个比方，农业发酵就像开发商建造洁净水屋。通风采光要良好，水电管网要齐全，墙面水泥砂浆要尽量抹平，腻子要尽可能涂白……
工业发酵就像购房者装修干净的房子，然后根据个人喜好进行装修。他喜欢在瓷砖上贴瓷砖，他喜欢在墙上贴壁纸，他喜欢画画画……